湖南农业大学苎麻研究所是由我国著名麻类专家李宗道教授创建和发展起来的，是在党和政府的重视和关怀下，随着苧麻生产的发展逐步创建的。

1963年，中共中央召开的“全国农业科学十年规划会议”，决定在全国高等农业院校中设置两个研究室，其中麻类研究室由农业部确定设在湖南农学院，重点开展苧麻学科的研究工作。这就是苧麻研究所的前身。

1984年，国家科学技术委员会为了充分发挥我国苧麻行业的优势，于12月批准成立由纺织工业部和湖南省政府共同领导的、面向全国的、工农联合的研究、开发机构“苧麻技术开发中心”。

1985年，在筹备成立“苧麻技术开发中心”的过程中，湖南省政府于决定将湖南农学院麻类研究室升格为湖南农学院苧麻研究所，与湖南省苎麻纺织研究所联合。 经湖南省编委和科委批准成立的省级科研机构，是全国第一个省级苎麻专业研究所。

    1986年，在长沙正式成立“苎麻技术开发中心”。湖南农学院苎麻研究所作为“苎麻技术开发中心农业部”。该中心的主要任务是开展苎麻良种选育、种植技术及综合利用的研究;开展苎麻纺织加工传统技术、新工艺、新技术及麻纺新品种的开发等研究;承担编制苎麻行业技术开发、技术改造、技术引进规划，拟定有关技术标准，开展测试和情报、咨询等工作。苎麻技术开发中心农业部主要负责苎麻种植和副产物综合利用等方面的研究及技术培训等工作。

    1997年，湖南农学院苎麻研究所随着“湖南农学院”升级为“湖南农业大学”而改名为“湖南农业大学苎麻研究所”。是全国少有的苎麻学科专业研究所和麻类学科博士学位授予单位，在苎麻科研与教学方面居国内外领先地位。 研究所作为湖南农业大学“作物栽培与耕作学”、“作物遗传育种学”学科重点依托单位之一，已培养苎麻学科的博士研究生40多人，硕士研究生200余人，曾开办纤维本科专业和多次举办全国麻类专业技术培训班。

近10年来承担国家自然科学基金项目8项，其他国家级、省部级项目80多项。获得了各类科研成果30余项，其中，国家发明奖1项，省级 16 项，2009年有两项成果分获中国纺织工业协会科技进步奖一等奖和湖南省科技进步奖二等奖，2016年与 华升集团及东华大学合作获得国家科技进步奖二等奖。育成苎麻新品种8个，其中高产、优质、抗病新品种“湘苎三号”，是全国唯一获得国家发明奖和 列入全国科技成果重点推广计划的苎麻新品种；苎麻优异种质“神七”搭载成功，获得了宝贵的太空育种 新材料。公开出版著作30多部，发表科研论文400多篇。获国家发明专利20项，累计经济效益达30亿元以上。获省优硕士、博士论文2篇。发表学术论文300多篇，其中，在PLOS ONE、BMC genomics、Frontiers in Plant Science、Plant Physiology and Biochemistry、Photosynthetica、Molecular Breeding、DNA AND CELL BIOLOGY等刊物上发表学术论文30余篇。

苎麻研究所已成为省部共建国家重点实验室培育基地的重要组成部分，在苎麻生产区建立了苎麻综合实验站，组建成立了湖南华升洞庭麻纺有限公司、湖南农业大学苎麻产业化研究基地; 组建了湖南华升集团、湖南农业大学、湖南华升洞庭麻纺有限公司、湖南苎麻研究中心联合的新型苎麻产业技术创新战略联盟。研究所还积极开展国内外学术交流工作，先后与印度、巴西、菲律宾、马来西亚、爱尔兰、法国等国家有关大学、研究单位进行了科研协作和交流。倡议、筹备并主持召开了“首届国际苎麻学术讨论会”， 在国内外产生了深远的影响。